Fondé au cours du XII° siècle, ou avant, sur la demande des abbés de Sarlat, le château de Commarque, qui n’est alors qu’une simple tour de bois, doit à l'origine assurer la sécurité de la vallée qui voit le croisement de deux routes commerciales importantes de la région : la route de Périgueux à Cahors et celle de Brive à Bergerac. Au XII° siècle il existe une agglomération, un donjon avec un logis, une chapelle indépendante et des maisons-tours : c'est le castrum de Commarque semi-troglodytique.

Progressivement, après que la famille de Beynac s'est rendue maîtresse du château, la tour en bois est remplacée par un donjon en pierre plusieurs fois rehaussé, en particulier en 1380, et couronné de mâchicoulis. Les seigneurs du lieu, les Beynac, logeaient dans le donjon seigneurial.

Plusieurs autres tours sont ensuite construites, accompagnées à chaque fois d'un logis. Les maisons-tours sont tenues par des lignages de petite noblesse dont quelques noms sont connus : les Commarque, les Cendrieux, les Gondrix, les La Chapelle, etc. Chaque maison-tour est constituée d’un enclos, d'accès propres et de fossés.

Pendant la guerre de Cent Ans, les Beynac restent les défenseurs fidèles de la couronne de France. Les Anglais s'emparent néanmoins du château en 1406 et le conservent pendant quelques années. Le déclin de la famille de Beynac date de cette époque. Dans les années 1500, il semble que le castrum soit déjà déserté par les anciennes familles résidentes. Plus tard, en 1569, le castrum est à nouveau pris pendant les guerres de Religion par les catholiques. C'est sans doute à cette époque que s'est effondrée la salle voûtée.

Guy de Beynac, dernier châtelain de Commarque, y meurt en 1656. Le site est abandonné définitivement au XVIII° siècle. Un siècle plus tard, le château est en ruine.

Chapelle Saint-Jean

L'une des portes d'entrée du castrum est située sous la chapelle Saint-Jean.

Celle-ci faisait partie de la paroisse de Sireuil. Récemment retrouvée, la pierre d'autel a été replacée. A droite, le lavabo est orné de motifs décoratifs. Les armes des Beynac (d'or à cinq burelles de gueules) sont sculptées sur le doubleau central.